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Título : Filogenia molecular del complejo de especies Epipedobates boulengeri.
Autor : Bruck, Stafan
López Hervas, Karem Stephania
Palabras clave : COMPLEJO DE ESPECIES
BOULENGERI
DIVERGENCIA GENÉTICA
FILOGENÉTICA
Fecha de publicación : 2017
Editorial : Quito: UCE
Citación : López Hervas, Karem Stephania (2017). Filogenia molecular del complejo de especies Epipedobates boulengeri. Informe final de investigación presentado como requisito para optar por el Título de Licenciado en Ciencias Biológicas y Ambientales. Carrera de Ciencias Biológicas y Ambientales. Quito: UCE. 43 p.
Resumen : El género Epipedobates también conocido como ranas venosas del Chocó, presentan colores llamativos y en muchos de los casos segregan sustancias tóxicas como mecanismo de protección hacia sus depredadores. La necesidad de entender los patrones de diversidad y las relaciones filogenéticas entre este grupo, ha revelado en varias estudios la estrecha relación filogenética, que se le atribuye a una baja divergencia genética entre las especies de este género. La poca información presente entre los marcadores moleculares ha limitado la posibilidad de evaluar la diversidad genética y detallar la estructura poblacional con respecto a este grupo, sin embargo estudios previos han mostrado que Epipedobates boulengeri es una especie polifilética en relación con otras especies perteneciente al género Epipedobates. El Objetivo de este estudio fue estimar la relaciones filogenéticas de Epipedobates boulengeri en relación con otras especies de este género y determinar si pertenece a una especie monofilética o representa un complejo de especies. Para esto se secuencio dos genes nucleares (BMP2 y H3) y dos genes mitocondriales (Citocromo B y Región control). Se secuenciaron un total de 47 individuos en 33 poblaciones, abarcando el rango de distribución de esta especie desde Valle del Cauca en Colombia y Cotopaxi en Ecuador. Los alineamientos se realizaron en Muscle y los modelos evolutivos fueron evaluados en PartiotionFinder, el análisis filogenético se realizó con máxima verosimilitud en GARLI y con inferencia bayesiana en MrBayes. Los resultados muestran que E. boulengeri es polifilética con respecto al holotipo de E. boulengeri de la Isla Gorgona en Colombia, además se sugiere que la delimitación de especies debe ser revisada, sin embargo los datos muestran que persiste un bajo nivel de divergencia molecular para las especies de Epipedobates, destacando la rápida diversificación fenotípica en relación reciente divergencia genética del género. La baja diversidad genética presente en el grupo (1.6% en el gen 16S, Tarvin et al. 2017) y la presencia de especies crípticasas hace un estudio interesante de genética de poblaciones y procesos de diversificación. Los resultados contribuyen para un mejor entendimiento de especiación en general y la identificación de especies importantes para la conservación de E. boulengeri, que tiene altos niveles de destrucción su hábitat natural en la región del Chocó entre Ecuador y Colombia
Frogs of the genus Epipedobates, known as Chocoan poison frogs, are brightly colored and secrete alkaloids as an anti-predator defense. Recent attempts to understand the diversification of this group have revealed very low genetic divergence among species (Tarvin et al., 2017). Such low divergence has limited our ability to assess genetic diversity and population structure of this group; however, these data suggest that Epipedobates boulengeri is polyphyletic. The objective of this study was to estimate the phylogeny of Epipedobates boulengeri in relation to other species of this genus and determine whether it belongs to a monophyletic species or represents a species complex. Were sequenced two nuclear (BMP2 and H3) and two mitochondrial (Cytochrome B and Control Region) markers for 47 individuals across 33 populations encompassing the range of this species, from the Valle de Cauca, Colombia, to Cotopaxi, Ecuador. Alignments were performed in Muscle, phylogenetic analysis was performed using maximum likelihood in GARLI and Bayesian inference in MrBayes. The results show that the Ecuadorian clade of E. boulengeri is polyphyletic with respect to the holotype of E. boulengeri from the Isla Gorgona, Colombia, suggesting that the delimitation of this species should to be reassessed. However, the find continued support for a low level of molecular divergence in Epipedobates, highlighting the rapid phenotypic diversification of the group in relation to the recent genetic divergence of the genus. The presence of such low genetic diversity (1.6% in 16S, Tarvin et al. 2017) and of cryptic species in Epipedobates make it an interesting case for the study of population genetics and diversification processes. The results contribute to the understanding of speciation in general and identify specific conservation concerns for E. boulengeri, which faces high rates of habitat destruction in the Chocó regions of Ecuador and Colombia
URI : http://www.dspace.uce.edu.ec/handle/25000/10511
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