Análisis filogenético del Gusano Barrenador del ganado en regiones tropicales y subtropicales del Ecuador

Abstract

El gusano barrenador del ganado (GBG), es la forma larvaria de la mosca Cochliomyia hominivorax propia del continente Americano. Hasta la fecha la mosca del GBG permanece endémico en Sur America excepto Chile y algunas Islas del Caribe. El Ecuador como parte del proyecto regional del control y erradicación del GBG de América, necesita actualizar su información epidemiológica y genética del GBG. Es por esto que, este estudio tiene como objetivo determinar la variabilidad genética de Gusano Barrenador del Ganado en zonas tropicales y subtropicales del Ecuador en base a una identificación morfológica y molecular mediante la construcción de árboles filogenéticos. En total, se identificaron 29 moscas de las cuales, el 10,3% (3/29) correspondieron a Cochliomyia hominivorax, el 62% (18/29) se identificó como Cochliomyia macellaria, el 3,44% (1/29) identificada como Dermatobia hominis y el 24,13% (7/29) de las moscas fueron identificadas como moscas de diferentes especies (Dasyphora sp, Ravinia pernix e Hydrotaea aenescens). De igual manera se identificaron 690 larvas provenientes de 52 miasis resultando el 90.15% como Cochliomyia hominivorax y dos muestras de huevos el 100% (2/2) correspondiente a Cochliomyia hominivorax. Posteriormente se realizaron los análisis moleculares mediante el uso de dos marcadores mitocondriales: COI subunidad I y 12S ARN. Las secuencias fueron utilizadas para la elaboración de seis árboles filogenéticos, mediante el método bayesiano y método de máxima verosimilitud, mostrando topologias con tres clados definidos correspondientes a las agrupaciones de Cochliomyia hominivorax, Cochliomyia macellaria y el grupo externo conformado por otros dípteros que fueron colectados en este estudio. En conclusión, los resultados muestran poca variabilidad genética entre las muestras colectadas en diferente región y/o provincia.

The cattle Screwworm (GBG) is the larval form of the fly Cochliomyia hominivorax specific to the American continent. Up to the present date the fly GBG remains endemic in South America, except for Chile and some Caribbean Islands. Ecuador as part of the regional project for the control and eradication of the GBG in America requires updating its epidemiological and genetic information. Whereby, the present study intends to determinate the genetic variability of the cattle screwworm in tropical and subtropical areas of Ecuador based on a morphological and molecular identification through the construction of phylogenetic trees. 29 flies were identified from which 10.3% (3/29) corresponds to Cochliomyia hominivorax, 62% (18/29) was identified as Cochliomyia macellaria, 3.44% (1/29) identified as Dermatobia hominis and 24.13% (7/9) were identified as flies from different species (Dasyphora sp, Ravinia pernix e Hydrotaea aenescens). Similarly 690 larvae coming from 52 myiasis were identified and 90.15% correspond to Cochliomyia hominivorax and two eggs samples from which 100% (2/2) correspond to Cochliomyia hominivorax. Subsequently, molecular analyses were carried out by means ot two mitocondrial markers COI subunit I and 12S ARN. Sequences were used to develop six phylogenetic trees through the Bayesian method and method of maximum likelihood, showing topologies with three defined clades corresponding to the group of Cochliomyia hominivorax, Cochliomyia macellaria and external group made up by other diptera collected in this study. In conclusion, the findings show low genetic variability among the samples collected in different region and or province.